项目背景: 高性能技术计算科学已逐渐成为人类科学研究的一大支柱。随着计算机技术的迅猛发展,强大的计算工具和物质基础为 HPC 的应用提供了可能,使人们可以借助计算科学来深化、优化、实验理论科学和扩展科学的研究,甚至在计算机系统上实现过去无法想象或根本无法触及的理论研究、应用开发和科学实验。在许多 HPC 应用领域,人们越来越期望借助计算机技术的新成果,通过更大规模...
SCALAPACK编译SCALAPACK(Scalable SAPACK)是一个并行计算软件包,适用于分布式并行计算机。它是为异构计算而设计的,支持任何MPI,具有高效、可移植、可伸缩、高可靠等优点,利用它的求解库可以开发出基于线性代数运算的并行应用程序。源码可以从http://netlib.org/scalapack下载。下载源码包:wget http://www.netl...
Intel-MKLIntel数学核心函数库(MKL)是一套高度优化、线程安全的数学例程、函数,面向高性能的工程、科学核财务应用。英特尔MKL的集群版本包括ScaLAPACK与分布式内存快速傅里叶转换,并提供了线性代数(BLAS、LAPACK和Sparse Solver)、快速傅里叶转换、矢量数学与随机号码生成器等功能。MKL的主要功能如下:BLAS和LAPACKS...
FFTW编译安装FFTW是一个快速计算离散傅里叶变换的标准C语言程序集,它包含对共享和分布式存储系统的并行变换,它可自动适应你的机器、缓存、存储器大小、寄存器个数。通常比目前其他开源Fourier变换程序都要快。编译前的准备工作需要并行计算,设置为可以使用MPI,首先在环境变量中指定MPIvi .bashrc添加以下语句:#OPENMPI3.1export PATH=/data/openmp...
BLAS(BasicLinearAlgebraSubprograms,基础线性代数程序集)是一个应用程序接口(API)标准,用以规范发布基础线性代数操作的数值库(如矢量或矩阵乘法)。Netlib用Fortran实现了BLAS的这些API接口,得到的库也叫做BLAS。
BLACSBLACS(Basic Linear Algebra Communication Subprograms)是基本线性代数通信子程序,目的是创建一个面向线性代数的消息传递接口,该接口可以在多种分布式存储平台上高效、统一地实现。源码可以从http:www.netlib.org/blacs下载下载源码包:wget http://www.netlib.org/blacs/m...
OpenMPI 4.0的编译安装安装步骤:下载源码包并解压wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.0.tar.bz2tar -xvf openmpi-4.0.0.tar.bz2根据OpenMPI 4.0的configur帮助说明,集群支持UCX,需要编译UCX编译安装UCXwget https:...
OpenMPI3.1的编译安装用GCC编译OpenMPI,C、C++、Fortran77和Fortran90的编译器分别为mpicc,mpicxx,mpif70和mpif90OpenMPI编译器语言类型MPI编译器CmpiccC++mpicxxFortran77mpif77Fortran90mpif90安装步骤:下载源码包并解压wget https://download.open-mpi.o...